Nowe publikacje Centrum Bioinformatyki i Genomiki Stosowanej

Z przyjemnością informujemy, że w marcu ukazały się dwie publikacje naukowe autorstwa dr Marcina Jąkalskiego z Centrum Genomiki i Bioinformatyki Stosowanej Wydziału Biologii UG.

Pierwsza z prac, opublikowana w czasopiśmie Journal of Translational Medicine (IF=7,5) dotyczy nieinwazyjnej oceny ekspresji PD-L1 oraz typu histologicznego niedrobnokomórkowego raka płuca (NSCLC) z wykorzystaniem analizy radiomicznej obrazów PET/CT. W badaniach wykazano, że zastosowanie metod uczenia maszynowego w analizie danych obrazowych umożliwia przewidywanie kluczowych cech biologicznych nowotworu bez konieczności wykonywania inwazyjnych procedur diagnostycznych. Badania przeprowadzono we współpracy z naukowcami z Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego oraz Uniwersytetu Medycznego w Łodzi.

Drugi artykuł, opublikowany w czasopiśmie PLOS ONE (IF=2,6) dotyczy wpływu czasu zimnego niedokrwienia (cold ischemia time, CIT) na profil ekspresji genów w prawidłowej błonie śluzowej jelita grubego. Autorzy wykazali, że opóźnienie między pobraniem a utrwaleniem materiału biologicznego może prowadzić do istotnych zmian w ekspresji genów, co ma znaczenie dla wiarygodności wyników dalszych badań molekularnych. Badania przeprowadzono we współpracy z naukowcami z Gdańskiego Uniwersytety Medycznego oraz Akademii Medycznej w Elblągu.

Z pracami można zapoznać się tutaj:

1. Tomasik B, Jąkalski M, Bieńkowski M, Teodorczyk J, Sobocki BK, Stawiski K, Burzynski J, Romanowicz G, Dziadziuszko R, Cytawa W, Mieczkowski J. Non-invasive assessment of PD-L1 status and histology in non-small cell lung cancer using 18F-FDG PET/CT radiomics. J Transl Med. 2026 Mar 18. doi: 10.1186/s12967-026-08029-w
2. Duzowska K, Opiełka M, Drężek-Chyła K, Kostecka A, Horbacz M, Skokowski J, Rostkowska O, Kobiela J, Kalinowski L, Dumanski JP, Piotrowski A, Jąkalski M, Filipowicz N. The effect of cold ischemia time on hypoxia, EMT, and apoptosis pathways in normal colon mucosa. PLoS One. 2026 Mar 20;21(3):e0321432. doi: 10.1371/journal.pone.0321432